中国科学院昆明植物研究所（下简称“研究所”）位于素有“春城”之称的昆明市北市区黑龙潭风景区，创建于1938年，经过80余年的发展与积累，已成为国际上在植物多样性、植物资源研究和生物技术产业领域具有重大影响的研究机构。研究所建有昆明和丽江两个园区，其中昆明园区占地面积1018亩。研究系统设置“三室一库一园”，即植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室、中国科学院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室、资源植物与生物技术重点实验室、中国西南野生生物种质资源库和昆明植物园。2015年首批进入中国科学院“特色研究所”试点单位，2018年通过建设验收进入正式运行阶段。 

    研究所建有公共技术服务中心、科技信息中心和丽江生态系统定位研究站等科研支撑体系，其中公共技术服务中心拥有众多先进的大型仪器设备，如800兆、600兆、500兆和400兆超导核磁共振仪、高分辨质谱仪、X射线晶体衍射仪、电子扫描显微镜、SOLEX基因组分析系统、生物芯片扫描仪、激光共聚焦显微镜等。标本馆收藏植物标本160余万份，种质资源库现已保存野生植物种子11305种90738份（达我国有花植物物种总数的三分之一），植物化学国家重点室保存单体化合物11546个，图书馆藏书27万册。近年来研究所在基础研究与应用研究方面取得了多项重大成果，获得国家、省部委多项奖励，其中植物学家吴征镒院士等主持编写的《中国植物志》摘得2009年度国家科技奖自然科学一等奖的桂冠；吴征镒院士获得2007年国家最高科学技术奖；周俊院士、孙汉董院士和李德铢研究员分别获2006、2008和2013年度云南省科学技术突出贡献奖。 

    研究所现有生物学和药学两个一级学科学位授权点，下设有植物学、生物化学与分子生物学、药物化学以及药理学4个博士学位点；现有植物学、生物化学与分子生物学、药物化学、药理学4个学术型硕士学位点以及生物与医药和药学2个专业型硕士学位点。在职科研和管理人员358人，副高级及以上研究人员199人，其中博士生导师59人，硕士生导师71人。2022年底在读研究生624人，其中留学生30人，分别来自乌兹别克斯坦、缅甸、肯尼亚、巴基斯坦和尼泊尔等国家。另有在所联合培养研究生及客座生100余人。 

    研究所作为中国科学院大学（下简称“国科大”）研究生培养单位之一，研究生毕业证书和学位证书颁发单位为国科大（联合培养计划除外）。研究所2024年面向全国招收硕士研究生。